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Linux+GPU+caffeの作り方

Linuxをインストールする
	このとき、nouveau ドライバが勝手にセットされる
	これがGPUを使う時の妨げになる

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NVIDIAのGPU設定の時に、次が必要となる
(GUIモード---Xが立ち上がっている---では 設定ができないため)

GUI -> CUI

sudo service lightdm stop
ctl+alt+F1 
ログインプロンプトが出るのでログインする

CUI -> GUI
sudo service lightdm start


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GPUの設定

ubuntuでは nouveau というgraphic driverが動いていて、これが邪魔をする
そのための作業:
http://askubuntu.com/questions/481414/install-nvidia-driver-instead-nouveau
に基づく

1) Blacklist the modules. Open the blacklist.conf file.

sudo vim /etc/modprobe.d/blacklist.conf

add the following modules in the file.

blacklist amd76x_edac #this might not be required for x86 32 bit users.

blacklist vga16fb

blacklist nouveau

blacklist rivafb

blacklist nvidiafb

blacklist rivatv

Save the file and exit.

2) Remove all the nvidia* packages

sudo apt-get remove --purge nvidia*

3) Once you are done with the steps above, reboot, stop the display manager and try to install nvidia drivers.

つまり、NVIDIAからダウンロードしてきたNVIDIA-Linux-x86_64-352.41.run
というような名前のファイルを実行シェルスクリプト, sudoすること)
これがないとUbuntuのデスクトップ環境が使えなくなる(CUIになる)

http://caffe.berkeleyvision.org/installation.html   を参照のこと

あと残るは、CUDAのインストール
To install CUDA, go to the NVIDIA CUDA website and follow installation instruct
ions there. 
https://developer.nvidia.com/cuda-downloads

ダウンロードしたファイルが cuda_7.5.18_linux.run ならば
sudo sh cuda_7.5.18_linux.run
とする

#---------------------------------------
cuDNN を使うと速くなる....

https://developer.nvidia.com/cudnn
からダウンロード、
cudnn-7.0-linux-x64-v3.0-prod.tgz
というような名前のファイル

これをインストールする（includeファイルとライブラリ)


後述のcaffeeのMakefile.configで (USE_CUDNN := 1 )と
適切に設定すること
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Press Ctrl-Alt-F1. Once you are in the text mode, stop the display manager. This will end all the applications, so you better close them yourself before completing this step.

To stop the display manager use the following command

sudo /etc/init.d/gdm stop
(sudo service lightdm stop でもよいはず---上記参照)

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caffeを作る；
http://www.nal.ics.es.osaka-u.ac.jp/personal/k-yamanishi/CaffeUbuntu.html
に基づく

sudo apt-get install nvidia-cuda-toolkit libatlas-base-dev libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libboost-all-dev libhdf5-serial-dev
sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev protobuf-compiler 
sudo apt-get install git  python-pip
------

caffee本体
3.1 Caffe のダウンロード

sudo apt-get install git

git clone https://github.com/BVLC/caffe.git

3.2 Makefile.config の設定

Makefile.config.example をgedit などで開き編集する:

########### CUDAがない場合
CUDA_DIR := /usr/local/cuda の行をコメントアウトし
# CUDA_DIR := /usr の行をアンコメントする
# CPU_ONLY := 1 をアンコメントする（仮想 OS 上の場合GPUがないため）

##################################

Makefile.config として保存

3.3 make  (-jオプションで並列処理)
make -j2    
make test
make runtest
(2つほど disabled testsが出た）
cuDNNで やったところ、
	1647 tests from 242 test cases ran. (221256 ms total
という結果が得られた HP Z440 workstation

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トラブルの対処
  makeの時に　hdf5.hというheader fileが見つからないエラーが出た場合
      Make.config ファイルの78行目、INCLUDE_DIRS に
      		  /usr/include/hdf5/serial   を追加する
      -lhdf5 (など)が見つからないというエラーが出た場合(includeファイ
      ルの時にエラーが出たなら、ほとんどこれもあてはまる)
      Make.config ファイルの79行目、LIBRARY_DIRS に
      		  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial を追加する

  cv::imread(...)に対する定義されていない参照です」というエラー
    が出た場合、 Makefileの 174行目(あたり)　LIBRARIESの指定に、
     opencv_imgcodecs を付け加える

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Pythonから使えるようにする

sudo apt-get install python-pip python-dev python-numpy python-skimage

cd caffe/python
bash
for req in $(cat requirements.txt); do sudo pip install $req; done

cd ..
make pycaffe

export PYTHONPATH=~/caffe/python/:$PYTHONPATH
 として環境変数を設定する必要あり

sudo gedit  /etc/profile 
として上記を書き込むと楽